其基本原理是利用微生物把溶解水中的恶臭物质吸收于微生物自身体内，通过微生物的代谢活动使其降解的一种过程。微生物脱臭可分为三个阶段：
①恶臭气体的溶解过程，即由气相转移到液相；
②水溶液中恶臭成分被微生物吸附、吸收；
③进入微生物细胞的恶臭成分作为营养物质为微生物所分解利用，使污染物得以去除。
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